การเดินทางโดยรถยนต์

เส้นทางถนนสายเพชรเกษม เลี้ยวเข้าแยกถนนพุทธมณฑล สาย 4 ผ่านหน้ามหาวิทยาลัยมหิดล ขับมาเรื่อยผ่านหอนาฬิกาจนมาถึงแยกสถานีตำรวจภูธรศาลายาแล้วเลี้ยวขวา ขับมาเรื่อย (ระยะทางอีกประมาณ 10 กิโลเมตร) จนเห็นป้ายมหาวิทยาลัยด้านหน้าทางเข้าซอย เลี้ยวซ้ายขับมาตามถนนจนเห็นที่ตั้ง มหาวิทยาลัย วิทยาเขตนครปฐมสามารถขับมาตามเส้นทางถนนปิ่นเกล้า - นครชัยศรี เข้าได้ 3 ทาง คือ

• จากสี่แยกสะพานกรุงธนบุรี ตรงมาตามถนนสายปิ่นเกล้า - นครชัยศรี
• จากสี่แยกสะพานพระปิ่นเกล้า ตรงมาตามถนนสายปิ่นเกล้า - นครชัยศรี
• จากปากทางบางขุนนนท์ เข้ามาทางตลิ่งชันแล้วเลี้ยวซ้ายมาบรรจบกับถนนปิ่นเกล้า - นครชัยศรี

การเดินทางโดยรถประจำทาง รถทัวร์โดยสาร รถตู้

โดยลงที่ป้ายประตู 4 มหาวิทยาลัยมหิดล แล้วต่อแท็กซี่หรือรถตู้ของมหาวิทยาลัยเข้ามา โดยสายรถเมล์ที่มาถึงศาลายามีดังนี้

• สาย 84ก (วงเวียนใหญ่ – ศาลายา)
• สาย 124 (สนามหลวง-มหิดล)
• สาย 125 (สะพานกรุงธน-มหิดล)
• สาย 388 (ปากเกร็ด-ศาลายา)
• สายปอ. 515 (อนุสาวรีย์ชัยสมรภูมิ-ศาลายา)
• สาย 556 (สถานีรถไฟมักกะสัน-วัดไร่ขิง)
• สายปอ.547 (มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลรัตนโกสินทร์-สถานีขนส่งจตุจักร)
• รถทัวร์โดยสารกรุงเทพฯ-นครปฐม ขึ้นได้ที่สถานีขนส่งสายใต้ใหม่ ซึ่งสามารถบอกให้รถจอดบริเวณตลาดพุทธ แล้วนั่งมอเตอร์ไซต์ต่อมาที่หน้ามหาวิทยาลัยมหิดลประตู 4 แล้วต่อด้วยแท็กซี่หรือรถตู้ของมหาวิทยาลัย
• รถตู้ปรับอากาศ (เซ็นทรัลปิ่นเกล้า – มหิดลศาลายา) ขึ้นรถที่ปั๊มน้ำมันข้างเซ็นทรัลปิ่นเกล้า
• รถตู้ปรับอากาศ (อนุสาวรีย์ชัยสมรภูมิ – มหิดลศาลายา) ขึ้นรถที่อนุสาวรีย์ชัยสมรภูมิตรงป้ายหน้า รพ.ราชวิถี

การเดินทางโดยรถไฟสายใต้

ขึ้นได้ที่สถานีธนบุรี (ใกล้ โรงพยาบาลศิริราช) หรือสถานีหัวลำโพง หรือสถานีนครปฐม โดยขบวนเที่ยวต่างๆ จะผ่านสถานีศาลายา ให้ลงที่สถานีศาลายาแล้ว นั่งรถรับจ้างเข้ามามหาวิทยาลัย หรือใช้บริการแท็กซี่โดยใช้เวลาเดินทางไม่เกิน 30 นาที ระยะทางจากศาลายามาถึงมหาวิทยาลัย วิทยาเขตนครปฐม ประมาณ 10 กิโลเมตร